Из-за неконтролируемого промысла, включая браконьерство, и антропогенного воздействия численность муксуна в Обско-Иртышском бассейне снизилась настолько, что в 2014 г. был введен запрет на его добычу, кроме целей аквакультуры и науки. Восстановлением популяции занимаются на Собском рыбозаводе в ЯНАО.
